【ED】エンディング①に分岐した島民は再会した時にタイムスリップのことを思い出すとのことですが、再会するまではタイムスリップ中に築いた関係性は覚えていないという認識でいいですか？

いいえ、覚えています。

タイムスリップ中に築いた関係性も踏まえ、島民は10年間生きてきました。

「思い出す」という表現は語弊がありましたので改めて表現しますと、島民は「自分が本来死んでいたはずの存在であること」を思い出すとともに、「旅行者が本当にタイムスリップしていたこと」を確信したor半信半疑だったが信じた、ということになります。