実験医学特集号「腸内細菌叢」に寄稿しました。
目次
序【大野博司】
概論-拡大・深化する常在細菌叢研究【大野博司】
第1章 常在細菌叢の基礎と解析技術
1．ロングリードシークエンサーを用いたヒトマイクロバイオーム解析の新展開【須田 亙】
2．メタゲノムデータの情報解析とデータベース【村上 匠，森 宙史，黒川 顕】
3．de novoアセンブリの新技術とメタゲノムへの応用【梶谷 嶺，伊藤武彦】
4．マイクロバイオームの数理モデル【高安伶奈】
5．マイクロバイオームの1細胞解析技術の現状【雪 真弘，大熊盛也】
第2章 常在細菌叢と生理・病理
Ⅰ 免疫・腫瘍免疫の制御
1．腸管上皮細胞の粘膜バリアによる腸内細菌制御【奥村 龍，竹田 潔】
2．腸管IgAによる腸内細菌制御【石垣佳祐，新藏礼子】
3．共生細菌が制御する自然リンパ球と疾患誘導【佐藤尚子，大野博司】
4．T細胞を誘導する腸内常在菌とがん免疫への関与【田之上 大，新 幸二，本田賢也】
5．腸内細菌叢とがん免疫応答【福岡聖大，西川博嘉】
Ⅱ 炎症・免疫関連疾患
6．炎症性腸疾患（IBD）と腸内細菌叢【大草敏史】
7．糞便微生物移植は腸内環境改善の最適解か？【水野慎大，金井隆典】
8．腸内細菌と自己免疫疾患【髙橋大輔，長谷耕二】
9．アレルギー疾患と腸内細菌叢【下条直樹】
10．菌叢，病原微生物のクオラムセンシングと皮膚炎惹起【松岡悠美】
11．口－腸－全身軸に基づく歯周病と全身疾患の関係【山崎和久】
Ⅲ 全身恒常性の制御
12．宿主代謝制御と腸内細菌叢【木村郁夫】
13．自己免疫疾患としての1型糖尿病と腸内細菌との関連【下川周子】
14．老化と腸内細菌【中西裕美子，大野博司】
Ⅳ 精神・神経系の制御，救急医療
15．腸内細菌叢や免疫系が情動に及ぼす影響【宮島倫生，Sidonia Fagarasan】
16．幼少期環境による中枢発達にかかわる腸内細菌叢の役割【菊水健史，上村いつか，茂木一孝】
17．パーキンソン病と腸内細菌叢【大野欽司，平山正昭】
18．多発性硬化症における腸内細菌の影響【宮内栄治，大野博司】
19． 救急・集中治療領域の腸内細菌叢と腸管内治療【清水健太郎，小倉裕司】
第3章 世界と日本の研究動向
1．ヒトマイクロバイオーム研究の産業への応用【寺内 淳，片岡二郎，藤井千之，梶浦貴之，笠原 堅，亀山恵司，柴垣奈佳子】
2．IHMC（国際ヒト細菌叢コンソーシアム）と世界細菌叢デー【Todd D. Taylor】
3．NIH（米国国立衛生研究所）でのヒト細菌叢研究の概要【Lita M. Proctor】
4．EU（欧州連合）におけるヒト細菌叢研究の資金調達と動向【Dirk Hadrich】
5．中国におけるヒト細菌叢研究の動向【Baohong Wang，Lanjuan Li】